LabDAO sta tracciando il futuro dell'intelligenza artificiale open source per la scoperta di farmaci

Il progetto Folding@home ha fatto notizia durante la pandemia di COVID-19 per aver utilizzato la potenza di calcolo inutilizzata per esplorare lo spazio di ricerca del ripiegamento proteico per affrontare il nuovo coronavirus. Consentendo ai cittadini di essere scienziati a pieno titolo, l'iniziativa ha eseguito simulazioni su larga scala di diverse configurazioni molecolari di proteine ​​attraverso una rete distribuita di computer "registrati" in tutto il mondo.

Questo paradigma decentralizzato è stato annunciato per riunire le persone attorno a un problema comune e alla potenza di calcolo del crowdsourcing in modo efficiente, ma cosa succederebbe se la potenza di calcolo e l'infrastruttura per la risoluzione dei problemi fossero invertite? In altre parole, cosa succederebbe se gli individui potessero gestire i propri progetti attingendo alla potenza di calcolo accumulata? ed gli strumenti per la sperimentazione biologica da avviare?

LabDAO sta trasformando quel sogno in realtà con la sua piattaforma PLEX. PLEX è uno strumento a riga di comando open source progettato per rendere accessibili non solo le risorse di elaborazione, ma anche una varietà di strumenti di apprendimento biologico-automatico (coniato la suite "BioML" all'interno di LabDAO) in una varietà di background. Che si tratti di sperimentare l'aggancio di piccole molecole o simulazioni di ripiegamento delle proteine, PLEX consente agli utenti di attingere alla libreria di strumenti di LabDAO, condividere i risultati e visualizzarli in meno di cinque minuti.

Questa suite di strumenti e la sua piattaforma di abilitazione all'uso su di essa è stata esposta al vertice Blockchain Meets Biology di Zuzalu all'inizio di aprile, dove Lily Hansen-Gillis, membro del LabDAO Core Team, ha dimostrato dall'inizio alla fine una simulazione delle dinamiche molecolari interne di un proteina per trovare la sua configurazione più stabile. Quindi, come autoproclamata "non programmatrice", ha accompagnato il pubblico dall'inizio alla fine, tutto con un computer, WiFi, PLEX sulla riga di comando e nient'altro.

Più in generale, LabDAO è una piattaforma decentralizzata abilitata al web3 (parte del più ampio movimento "DeSci") impegnata a creare un ambiente più produttivo per la scoperta di farmaci alimentati da open source. Mettendo a disposizione di un ecosistema più ampio strumenti e risorse all'avanguardia, LabDAO mira a creare l'ambiente giusto per progressi scientifici trasparenti e accessibili. Sia eliminando la necessità per i ricercatori di avere il proprio hardware o infrastruttura informatica o pubblicando i risultati degli esperimenti su un libro mastro blockchain in modo che siano trattabili e riproducibili, l'organizzazione si impegna a rendere possibile più innovazione attraverso la collaborazione, abbattendo le barriere causate da scarsa usabilità e silos, competenze di nicchia.

Gli sforzi di LabDAO per costruire questo mondo DeSci del futuro per oggi hanno recentemente ricevuto una spinta sotto forma di un round di finanziamento di $ 3.6 milioni da vari altri DAO, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan e altri. Questo afflusso di supporto contribuirà agli sforzi in corso per creare strumenti software open-source e rafforzare l'ecosistema di ricerca di LabDAO.

Per quanto riguarda PLEX stesso, i prossimi passi immediati all'orizzonte includono il test della piattaforma in diverse collaborazioni scientifiche, la containerizzazione di vari strumenti e l'accumulo dell'hardware necessario per promuovere la rete BioML.

Per quanto riguarda il lungo termine, forse il prossimo farmaco salvavita durante la prossima grande epidemia di malattie infettive sarà progettato con la potenza di PLEX, un passo avanti decentralizzato alla volta. Mentre l'ecosistema continua a crescere, solo il tempo lo dirà.

Grazie a voi Aishani Aatresh per ulteriori ricerche e rapporti su questo articolo. Sono il fondatore di SynBioBeta e alcune delle aziende di cui scrivo sono sponsor di Conferenza SynBioBeta. Per ulteriori contenuti, puoi iscriverti a la mia newsletter settimanale.